O geossítio Fraga do Pena resulta do lacólito de Mação-Penhascoso, corpo granítico, hipabissal, que acompanha o dobramento em sinclinal dos metassedimentos que constituem a sucessão do Paleozóico, e que no flanco SW contacta ainda com o plutonito intrusivo de Belver.
No topo, o lacólito granítico de Mação-Penhascoso contacta de modo intrusivo com estratos quartzíticos ou concordantemente com bancadas de pelitos negros.
No leito e nas margens da ribeira do Coadouro ocorrem ainda numerosos xenólitos, por vezes laminados e recristalizados.
Este corpo granítico, relativamente aplanado e agricultado, corresponde a um granito muito alterado, de modo a que as observações são prejudicadas pelo grau de alteração e arenização.